A sincronização é somente do Skype para contatos, de contatos para o Skype é no momento da busca e você deverá selecionar organização ou dispositivo.

Organização: será sincronizado os contatos que estão configurado na sua conta Exchange, caso a conta esteja sincronizando contatos eles serão exibidos como organização.

Dispositivo: A busca será efetuada nos contatos do dispositivo.